Lu ailleurs / Néandertal pourrait venir au secours de la santé de Sapiens
Le crâne et les reste de "Shanidar I", homme de Néandertal découvert à Erbil (Irak), datant de -60'000 à -45'000, conservé au musée de Bagdad. © Osama Shukir Muhammed Amin FRCP(Glasg) - CC BY-SA 4.0
Le magazine «Nature» explique comment des bioingénieurs ont utilisé l'intelligence artificielle pour ramener des molécules d'entre les morts. Dans des protéines de l’homme de Néandertal et de l’homme de Denisova, ils en ont identifié qui sont capables de nous aider à lutter contre des infections pour lesquelles les antibiotiques actuels deviennent moins performants.
L’homme de Néandertal a disparu il y a plusieurs millénaires – il y a peut-être 30'000 ans – mais le voilà aujourd’hui qui vient au secours de la santé de son cousin Sapiens – nous, avec lequel il a cohabité avant de lui laisser toute la place sur la planète Terre. Un autre de nos «cousins» lui aussi disparu vers la même époque, l’homme de Denisova, pourrait également nous donner un coup de main.
C’est au moyen de l’intelligence artificielle que des scientifiques essaient de trouver des protéines de Néandertal et de Denisova, ceci dans le but de ressusciter des antibiotiques «éteints». «Nos recherches consistent à ramener des molécules du passé afin de résoudre des problèmes actuels», explique Cesar de la Fuente, coauteur de l'étude et bioingénieur à l'université de Pennsylvanie. Une étude publiée le 28 juillet dans Cell Host & Microbe.
Inspirer de nouveaux médicaments
Nature explique: «Pour réaliser cette "dé-extinction" moléculaire, les chercheurs ont examiné des données de protéines provenant à la fois de l'homme moderne et de nos parents disparus depuis longtemps, les Néandertaliens et les Denisoviens. Ils ont ainsi pu identifier des molécules capables de tuer des bactéries pathogènes, ce qui pourrait inspirer de nouveaux médicaments pour traiter les infections humaines.»
Le magazine rappelle que le développement des antibiotiques s'est ralenti au cours des dernières décennies et que la plupart de ceux aujourd’hui prescrits sont sur le marché depuis plus de 30 ans. Or, les bactéries résistantes aux antibiotiques sont de plus en plus nombreuses. «Les protéines des espèces disparues pourraient constituer une ressource inexploitée pour le développement d'antibiotiques.»
Cesar de la Fuente est très optimiste, expliquant que «trouver et tester des médicaments à l'aide de l'intelligence artificielle ne prend que quelques semaines. En revanche, il faut de trois à six ans pour découvrir un seul nouvel antibiotique avec les anciennes méthodes.»
Des résultats mitigés
Les essais réalisés en laboratoire sur des souris ont pourtant eu des résultats mitigés. «Les chercheurs ont testé des dizaines de peptides (de courtes chaînes d'acides aminés) pour voir s'ils pouvaient tuer des bactéries. Ils ont ensuite sélectionné six peptides puissants – quatre provenant de Sapiens, un de Néandertal et un de Denisova – et les ont administrés à des souris infectées par la bactérie Acinetobacter baumannii, une cause fréquente d'infections hospitalières chez l'homme. Les six peptides ont stoppé la croissance de la bactérie dans le muscle de la cuisse, mais aucun ne l’a tuée. Cinq des molécules ont tué les bactéries se développant dans les abcès cutanés, mais les doses utilisées étaient "extrêmement élevées", explique Nathanael Gray, biologiste chimiste à l'Université de Stanford.»
Un algorithme à améliorer
Selon Cesar de la Fuente, l'adaptation des molécules les plus efficaces pourrait permettre de créer des versions plus performantes. Et la modification de l'algorithme pourrait améliorer l'identification des peptides antimicrobiens en réduisant le nombre de faux positifs. «Même si l'algorithme que nous avons utilisé n'a pas produit de molécules extraordinaires, je pense que le concept et le cadre représentent une nouvelle façon d'envisager la découverte de médicaments», a affirmé le chercheur.
Nathanael Gray, lui, trouve l’idée générale intéressante, mais il pense que «tant que l'algorithme ne sera pas en mesure de prédire avec plus de succès les peptides cliniquement pertinents, la dé-extinction moléculaire n’aura pas un grand impact sur la découverte de médicaments».
Euan Ashley, un spécialiste de la génomique et de la santé de précision à l'université de Stanford, en Californie, se réjouit de son côté de cette nouvelle approche dans le domaine peu étudié de la mise au point d'antibiotiques. «Cesar de la Fuente et ses collègues m'ont persuadé que plonger dans le génome humain archaïque était une approche intéressante et potentiellement utile.»
Même s’il semble y avoir encore loin de la coupe aux lèvres, voilà un exemple d’utilisation positive de l’intelligence artificielle.
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Comme toutes les chaînes régionales, elle donne d’intéressantes indications sociologiques sur qui nous sommes, nous les Romands.</p> <p>Prenons par exemple l’émission <em>Oui Chef Académie</em>, dont la finale a lieu ce dimanche 15 décembre –tous les épisodes restent en dégustation libre sur le site de <a href="https://latele.ch/emissions/oui-chef-academie" target="_blank" rel="noopener"><em>La Télé</em></a>. Huit jeunes cuisiniers de Suisse romande se sont affrontés durant plusieurs semaines dans des épreuves culinaires, sous le regard attentif des chefs Guy Ravet et Christian Segui, secondés par d’autres personnalités de la gastronomie romande. Une sorte de <a href="https://www.m6.fr/top-chef-p_872" target="_blank" rel="noopener"><em>Top Chef</em></a> à la sauce d’ici. 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Habillés comme dans les années disco, perruqués, ils mettaient en scène les membres d’un groupe pop suédois des années 1980 tragiquement congelés lors d’une escapade en forêt, nus et ivres. Le réchauffement climatique a fait que vingt ans plus tard, Morten, Preben, Tåg et Bra ont été décongelés et ont retrouvé la scène. Dans Morning Wood, on les retrouve dans leur chalet, à soixante kilomètres de Stockholm. Ils parlent bien sûr en suédois et des sous-titres permettent aux spectateurs de comprendre leurs échanges tout à fait hilarants. Et ils chantent, la plupart du temps a capella, et ils font ça très bien, en plus dans des chorégraphies tout à fait amusantes. Avec le nouveau spectacle, nous les «retrouvons nourrissant une jalousie maladive envers leurs rivaux de toujours, un quatuor italien au charme ravageur: les Spag. 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C’est tout à fait réjouissant pour ses lecteurs, aussi pour celles et ceux qui, comme nous à Bon pour la tête, aiment passionnément les aventures éditoriales. Celle que mènent depuis dix ans Christine Mercier et Justin Favrod est exemplaire en plus d’être réussie. «Pour maintenir le niveau actuel de plus de 4100 abonnements, il nous faut en gagner un nouveau par jour. (…) Nous courons les marchés et les foires pour distribuer la revue et montrer que, loin de s’adresser aux spécialistes, elle ambitionne de distraire et de cultiver le plus grand nombre», explique Christine dans son édito. Et qui l'a vue en action sait qu’elle ne se paie pas de mots. 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Peut-être pas… Qui dit Noël, dit, entre autres, téléfilms de Noël et <a href="https://www.ouest-france.fr/leditiondusoir/2024-12-06/cinq-choses-etonnantes-que-vous-ignorez-peut-etre-sur-les-telefilms-de-noel-e0034476-c288-4b47-beeb-f9a71a886c7d" target="_blank" rel="noopener"><em>Ouest France</em></a> en dévoile les dessous. «Ils utilisent de la fausse neige», révèle le quotidien français. Je citerais bien une fois de plus Guy Debord – «Tout ce qui était directement vécu s’est éloigné dans une représentation» – mais j’ai peur de lasser. Par contre, je vous encourage à chercher, cette année, ce qui sera par vous directement vécu durant les fêtes de Noël. Je suis prêt à tout entendre – surtout si c’est salace – mais à celles et ceux qui évoqueront la «magie de Noël» je demanderai des précisions et ne me contenterai pas de trucs éculés, de fausse neige. 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La compagnie a proposé un remboursement de 50% mais des passagers russes ont décidé de faire la grève de la faim pour obtenir un remboursement complet. C’est justement en Russie qu’à eu lieu la <a href="https://fr.wikipedia.org/wiki/Gr%C3%A8ve_de_la_faim" target="_blank" rel="noopener">première grève de la faim</a> répertoriée, en 1878, à Saint-Pétersbourg, dans une prison où des détenus politiques voulaient ainsi protester contre des conditions de détention inhumaines. La grève de la faim étant plutôt – et paradoxalement – une arme de crève-la-faim, qui va prendre en pitié les passagers grévistes? Quoi qu’il en soit, il est réjouissant que le paquebot et ses passagers n’aient pas pu aller emmerder les manchots sur leur banquise.</p> <h3><strong>La religion capitaliste a son prophète</strong></h3> <p>Si les pingouins ont gagné en tranquillité, ce n’est pas le cas des vaches. 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VOS RÉACTIONS SUR LE SUJET
1 Commentaire
@stef 03.09.2023 | 16h08
«Très intéressant »